基于成本优势，天然气和煤炭是氢气制备的主要来源，但水电解制氢碳排放最低。在目前生产的7000万吨的氢气中，76%来自天然气，其余23%几乎全部来自煤炭，极少部分来自水电解。由于天然气和煤炭制氢过程中易产生大量二氧化碳排放，因此发展水电解制氢成为人们关注的重点。在成本方面，采用天然气制备的氢气价格为1.5-3美元/kg，而采用可再生电力制备的氢气价格为2.5-6美元/kg，氢气成本很大程度上受天然气价格和电价的影响，据估算，当天然气价格为11美元/MBtu时，可再生电价须降至30-45美元/MWh才可与之竞争。制氢方式的选择还取决于各国资源丰富程度、投资约束、对碳排放的接受程度等因素的影响。 

　　氢的储存和运输成本跟不同的技术选择有关，而应当选择哪种储运技术受众多因素影响，如：运送距离、运送数量、储存时间。短时且少量的氢气储存可以采用将氢转化成氢基燃料的方法，对于这种方法，氢基产品的最大成本构成是典型的电力，约占40-70%的生产成本氢基产品，因此降低电力是一个重要的目标，同时提高转换链。另外一种方法是储罐储存，储罐储存氢气可以应用于燃料汽车，有非常广阔的前景，但是安全性能仍待提高。长时且大量的氢气可以被储存到盐穴、油气藏或含水层。目前盐穴应用较广泛，因为它相对成本较低、污染较小。氢的运输主要通过管道、卡车、船只，管道一般用于长距离的运输，卡车和船只用于短距离运输，管道的资本成本非常高，但是边际成本比较低，长距离的氢的运输通过管道运输可以有效降低成本。